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水中的氨氮的含量是养殖水体中主要的检测指标，也是重要环境水体检测指标，氨氮是含氮有机物受微生物作用的分解产品，某些工业废水、养殖水中过多的饲料和鱼、虾等水中生物的排泄物累积都会产大量的氨氮。在无氧的条件下水中的亚硝酸盐也可受微生物作用，还原为氨。
另外氨氮是植物的营养物质，如果湖泊、水库等缓流水体中含有大量的氨氮时会引起澡类的大量繁殖，导至水体的富营养化。
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